FreeStatistics.org

Free Statistics

of Irreproducible Research!

Description of Statistical Computation

Author's title

Author*The author of this computation has been verified*
R Software Modulerwasp_pairs.wasp
Title produced by softwareKendall tau Correlation Matrix
Date of computationThu, 06 Nov 2008 07:07:58 -0700
Cite this page as followsStatistical Computations at FreeStatistics.org, Office for Research Development and Education, URL https://freestatistics.org/blog/index.php?v=date/2008/Nov/06/t1225980540bygkkr8j6zxaafu.htm/, Retrieved Sun, 19 May 2024 07:08:24 +0000
Statistical Computations at FreeStatistics.org, Office for Research Development and Education, URL https://freestatistics.org/blog/index.php?pk=22187, Retrieved Sun, 19 May 2024 07:08:24 +0000
QR Codes:

Original text written by user:
IsPrivate?No (this computation is public)
User-defined keywords
Estimated Impact156

Tree of Dependent Computations

Family? (F = Feedback message, R = changed R code, M = changed R Module, P = changed Parameters, D = changed Data)
F     [Mean Plot] [workshop 3] [2007-10-26 12:14:28] [e9ffc5de6f8a7be62f22b142b5b6b1a8]
F RMPD    [Kendall tau Correlation Matrix] [T2Q1] [2008-11-06 14:07:58] [434228f9e3c7eaa307f0fb12855e2147] [Current]
Feedback Forum
2008-11-09 19:39:28 [006ad2c49b6a7c2ad6ab685cfc1dae56] [reply] 
Fout geïnterpreteerd. RCF is de beste predictor voor RNR omdat er een lineair verband is tussen de twee, dit kan je zien op de grafiek en aan de waarde 0,01. De getallen geven de probabiliteit weer. Dit wil zeggen in welke mate de correlatie kan worden toegeschreven aan toeval. De getallen geven de betrouwbaarheid van de berekeningen weer. Een probabiliteit van 0,01 wil dus zeggen dat er een betrouwbaarheid is van 99%. De p-waarde in de tabel moet kleiner zijn dan 0,05 om een goede correlatie te hebben.
  2008-11-11 15:55:06 [Roel Geudens] [reply] 
Dat is zeker fout geïnterpreteerd. Hier verwisselt de student de p-waarde met de tau-waarde. In de tabel die ook bij deze output zit krijg je zowel de p-waarde als de tau-waarde ggeven. In de plot zien we een lage p-waarde van 0.01 met de bijhorende rechte grafiek.
2008-11-12 09:55:38 [Maarten Van Gucht] [reply] 
Q1: De student heeft deze vraag verkeerd begrepen of geïnterpreteerd. Hoe LAGER de p-waarde, hoe beter de correlatie en hoe meer betrouwbaarder deze is. Als je vb 95% betrouwbaarheid moet hebben, dan moet de p-waarde onder de 0,05 liggen. De student heeft wel gebruik gemaakt van de Kendall Tau correlation, wat wel goed is. Door deze aanpak kan je verschillende correlaties tegelijk berekenen.
2008-11-12 11:02:17 [Stef Vermeiren] [reply] 
De student heeft een fout antwoord gegeven. Het verband tussen RNR en RCF is de beste oplossing omdat deze nagenoeg een lineair verband geeft met een waarde van 0.01 (=p-value). Hoe lager deze waarde hoe beter. De p-waarde geeft de probabiliteit weer en dat is het toeval dat het getal zich voordoet.

er moet ook vermeld worden dat de p-waarde steeds onder de 0.05 moet liggen.
2008-11-14 15:16:20 [Annemiek Hoofman] [reply] 
Ik weet dat ik het fout geïnterpreteerd heb, ik dacht eerst dat alles onder de hoofddiagonaal de correlatie weergaf. Nu weet ik wel beter :)

Post a new message

Dataset

Dataseries X:
Download CSV
Histogram
Boxplots 
4,2	4,8	20,8	0,9	39,6
2,6	-4,2	17,1	0,85	36,1
3	1,6	22,3	0,83	34,4
3,8	5,2	25,1	0,84	33,4
4	9,2	27,7	0,85	34,8
3,5	4,6	24,9	0,83	33,7
4,1	10,6	29,5	0,83	36,3

Tables (Output of Computation)





Summary of computational transaction
Raw Inputview raw input (R code)
Raw Outputview raw output of R engine
Computing time1 seconds
R Server'George Udny Yule' @ 72.249.76.132

\begin{tabular}{lllllllll}
\hline
Summary of computational transaction \tabularnewline
Raw Input & view raw input (R code)  \tabularnewline
Raw Output & view raw output of R engine  \tabularnewline
Computing time & 1 seconds \tabularnewline
R Server & 'George Udny Yule' @ 72.249.76.132 \tabularnewline
\hline
\end{tabular}
%Source: https://freestatistics.org/blog/index.php?pk=22187&T=0

[TABLE]
[ROW][C]Summary of computational transaction[/C][/ROW]
[ROW][C]Raw Input[/C][C]view raw input (R code) [/C][/ROW]
[ROW][C]Raw Output[/C][C]view raw output of R engine [/C][/ROW]
[ROW][C]Computing time[/C][C]1 seconds[/C][/ROW]
[ROW][C]R Server[/C][C]'George Udny Yule' @ 72.249.76.132[/C][/ROW]
[/TABLE]
Source: https://freestatistics.org/blog/index.php?pk=22187&T=0

Globally Unique Identifier (entire table): ba.freestatistics.org/blog/index.php?pk=22187&T=0

As an alternative you can also use a QR Code:  
QR Code


The GUIDs for individual cells are displayed in the table below:

Summary of computational transaction
Raw Inputview raw input (R code)
Raw Outputview raw output of R engine
Computing time1 seconds
R Server'George Udny Yule' @ 72.249.76.132






Kendall tau rank correlations for all pairs of data series
pairtaup-value
tau( RNVM , RNR )0.7142857142857140.0301587301587301
tau( RNVM , RCF )0.5238095238095240.136111111111111
tau( RNVM , RLEZ )0.2646280620124820.427262856745706
tau( RNVM , REV )0.3333333333333330.381349206349206
tau( RNR , RCF )0.809523809523810.0107142857142857
tau( RNR , RLEZ )-0.05292561240249630.873844698517373
tau( RNR , REV )0.04761904761904761
tau( RCF , RLEZ )-0.2646280620124820.427262856745706
tau( RCF , REV )-0.1428571428571430.772619047619048
tau( RLEZ , REV )0.3704792868174740.266379923342483

\begin{tabular}{lllllllll}
\hline
Kendall tau rank correlations for all pairs of data series \tabularnewline
pair & tau & p-value \tabularnewline
tau( RNVM , RNR ) & 0.714285714285714 & 0.0301587301587301 \tabularnewline
tau( RNVM , RCF ) & 0.523809523809524 & 0.136111111111111 \tabularnewline
tau( RNVM , RLEZ ) & 0.264628062012482 & 0.427262856745706 \tabularnewline
tau( RNVM , REV ) & 0.333333333333333 & 0.381349206349206 \tabularnewline
tau( RNR , RCF ) & 0.80952380952381 & 0.0107142857142857 \tabularnewline
tau( RNR , RLEZ ) & -0.0529256124024963 & 0.873844698517373 \tabularnewline
tau( RNR , REV ) & 0.0476190476190476 & 1 \tabularnewline
tau( RCF , RLEZ ) & -0.264628062012482 & 0.427262856745706 \tabularnewline
tau( RCF , REV ) & -0.142857142857143 & 0.772619047619048 \tabularnewline
tau( RLEZ , REV ) & 0.370479286817474 & 0.266379923342483 \tabularnewline
\hline
\end{tabular}
%Source: https://freestatistics.org/blog/index.php?pk=22187&T=1

[TABLE]
[ROW][C]Kendall tau rank correlations for all pairs of data series[/C][/ROW]
[ROW][C]pair[/C][C]tau[/C][C]p-value[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RNVM , RNR )[/C][C]0.714285714285714[/C][C]0.0301587301587301[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RNVM , RCF )[/C][C]0.523809523809524[/C][C]0.136111111111111[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RNVM , RLEZ )[/C][C]0.264628062012482[/C][C]0.427262856745706[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RNVM , REV )[/C][C]0.333333333333333[/C][C]0.381349206349206[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RNR , RCF )[/C][C]0.80952380952381[/C][C]0.0107142857142857[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RNR , RLEZ )[/C][C]-0.0529256124024963[/C][C]0.873844698517373[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RNR , REV )[/C][C]0.0476190476190476[/C][C]1[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RCF , RLEZ )[/C][C]-0.264628062012482[/C][C]0.427262856745706[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RCF , REV )[/C][C]-0.142857142857143[/C][C]0.772619047619048[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RLEZ , REV )[/C][C]0.370479286817474[/C][C]0.266379923342483[/C][/ROW]
[/TABLE]
Source: https://freestatistics.org/blog/index.php?pk=22187&T=1

Globally Unique Identifier (entire table): ba.freestatistics.org/blog/index.php?pk=22187&T=1

As an alternative you can also use a QR Code:  
QR Code


The GUIDs for individual cells are displayed in the table below:

Kendall tau rank correlations for all pairs of data series
pairtaup-value
tau( RNVM , RNR )0.7142857142857140.0301587301587301
tau( RNVM , RCF )0.5238095238095240.136111111111111
tau( RNVM , RLEZ )0.2646280620124820.427262856745706
tau( RNVM , REV )0.3333333333333330.381349206349206
tau( RNR , RCF )0.809523809523810.0107142857142857
tau( RNR , RLEZ )-0.05292561240249630.873844698517373
tau( RNR , REV )0.04761904761904761
tau( RCF , RLEZ )-0.2646280620124820.427262856745706
tau( RCF , REV )-0.1428571428571430.772619047619048
tau( RLEZ , REV )0.3704792868174740.266379923342483


Figures (Output of Computation)

Input Parameters & R Code

Parameters (Session):
Parameters (R input):
R code (references can be found in the software module):
panel.tau <- function(x, y, digits=2, prefix='', cex.cor)
{
usr <- par('usr'); on.exit(par(usr))
par(usr = c(0, 1, 0, 1))
rr <- cor.test(x, y, method='kendall')
r <- round(rr$p.value,2)
txt <- format(c(r, 0.123456789), digits=digits)[1]
txt <- paste(prefix, txt, sep='')
if(missing(cex.cor)) cex <- 0.5/strwidth(txt)
text(0.5, 0.5, txt, cex = cex)
}
panel.hist <- function(x, ...)
{
usr <- par('usr'); on.exit(par(usr))
par(usr = c(usr[1:2], 0, 1.5) )
h <- hist(x, plot = FALSE)
breaks <- h$breaks; nB <- length(breaks)
y <- h$counts; y <- y/max(y)
rect(breaks[-nB], 0, breaks[-1], y, col='grey', ...)
}
bitmap(file='test1.png')
pairs(t(y),diag.panel=panel.hist, upper.panel=panel.smooth, lower.panel=panel.tau, main=main)
dev.off()
load(file='createtable')
a<-table.start()
a<-table.row.start(a)
a<-table.element(a,'Kendall tau rank correlations for all pairs of data series',3,TRUE)
a<-table.row.end(a)
a<-table.row.start(a)
a<-table.element(a,'pair',1,TRUE)
a<-table.element(a,'tau',1,TRUE)
a<-table.element(a,'p-value',1,TRUE)
a<-table.row.end(a)
n <- length(y[,1])
n
cor.test(y[1,],y[2,],method='kendall')
for (i in 1:(n-1))
{
for (j in (i+1):n)
{
a<-table.row.start(a)
dum <- paste('tau(',dimnames(t(x))[[2]][i])
dum <- paste(dum,',')
dum <- paste(dum,dimnames(t(x))[[2]][j])
dum <- paste(dum,')')
a<-table.element(a,dum,header=TRUE)
r <- cor.test(y[i,],y[j,],method='kendall')
a<-table.element(a,r$estimate)
a<-table.element(a,r$p.value)
a<-table.row.end(a)
}
}
a<-table.end(a)
table.save(a,file='mytable.tab')