FreeStatistics.org

Free Statistics

of Irreproducible Research!

Description of Statistical Computation

Author's title

Author*The author of this computation has been verified*
R Software Modulerwasp_pairs.wasp
Title produced by softwareKendall tau Correlation Matrix
Date of computationTue, 04 Nov 2008 12:52:13 -0700
Cite this page as followsStatistical Computations at FreeStatistics.org, Office for Research Development and Education, URL https://freestatistics.org/blog/index.php?v=date/2008/Nov/04/t1225828396hpi4s26kz983fyz.htm/, Retrieved Sun, 19 May 2024 04:11:24 +0000
Statistical Computations at FreeStatistics.org, Office for Research Development and Education, URL https://freestatistics.org/blog/index.php?pk=21649, Retrieved Sun, 19 May 2024 04:11:24 +0000
QR Codes:

Original text written by user:
IsPrivate?No (this computation is public)
User-defined keywords
Estimated Impact178

Tree of Dependent Computations

Family? (F = Feedback message, R = changed R code, M = changed R Module, P = changed Parameters, D = changed Data)
F       [Kendall tau Correlation Matrix] [opdracht 2 q1 (1)] [2008-11-04 19:52:13] [e7b1048c2c3a353441b9143db4404b91] [Current]
Feedback Forum
2008-11-09 15:02:44 [Gert-Jan Geudens] [reply] 
Ik ga zeker en vast akkoord met het antwoord van de studente. Zij zegt dat de RCF een hoge correlatie heeft met de RNR. De theorie leert ons dat des te dichter de correlatie gelijk is aan 1, des te groter het verband tussen de 2 variabelen.
In haar antwoord staat ook dat de scatterplot een lineair verband vertoont. Dit klopt volledig.
De p-waarde of chi-kwadraat waarde is volgens de studente gelijk aan 0.01. Wanneer deze waarde kleiner is dan 0.05 spreekt men van significantie. In dit geval de kans slecht 1% dat deze hoge correlatie te wijten is aan toeval.
2008-11-09 15:05:03 [Gert-Jan Geudens] [reply] 
Ik ga zeker en vast akkoord met het antwoord van de studente. Zij zegt dat de RCF een hoge correlatie heeft met de RNR. De theorie leert ons dat des te dichter de waarde gelijk is aan 1, des te groter de positieve correlatie tussen de 2 variabelen.
In haar antwoord staat ook dat de scatterplot een lineair verband vertoont. Dit klopt volledig.
De p-waarde of chi-kwadraat waarde is volgens de studente gelijk aan 0.01. Wanneer deze waarde kleiner is dan 0.05 spreekt men van significantie. In dit geval de kans slecht 1% dat deze hoge correlatie te wijten is aan toeval.
2008-11-10 18:48:55 [Jasmine Hendrikx] [reply] 
Eigen evaluatie Q1:

De juiste module is gebruikt, namelijk de Kendall tau correlation. Deze methode is aangewezen omdat we zo alle variabelen in 1 keer kunnen bestuderen. De Kendall tau correlation heeft op de diagonaal allemaal histogrammen. Rechts van de diagonaal vinden we de scatterplots en links van de diagonaal zien we getallen die een identificatie geven in welke mate het verband toe te wijten is aan toeval. Er is juist geconcludeerd dat de RCF de beste predictor is voor RNR. Wat in de conclusie wel niet gebruikt is, is de tabel met de tau en p-waarden. Deze is echter wel interessant omdat we daar de correlatiecoëfficiënt uit kunnen afleiden. We zien dat deze voor het verband RCF en RNR 0.81 bedraagt, wat het hoogste is van allemaal. Hoe dichter tegen 1, hoe beter. In de tabel kan men ook de p-waarde aflezen. Deze bedraagt voor het verband tussen RCF en RNR 0.01 wat dus kleiner is dan 0.05, en bijgevolg significant is. Uit deze gegevens kunnen we dus inderdaad concluderen dat RCF de beste predictor is van RNR. Aanvullend zou er misschien ook vermeld mogen worden dat men in de gegevensreeks de rijen en kolommen heeft moeten transponeren om de Kendall tau correlation te kunnen maken.

Post a new message

Dataset

Dataseries X:
Download CSV
Histogram
Boxplots 
4,2	4,8	20,8	0,9	39,6
2,6	-4,2	17,1	0,85	36,1
3	1,6	22,3	0,83	34,4
3,8	5,2	25,1	0,84	33,4
4	9,2	27,7	0,85	34,8
3,5	4,6	24,9	0,83	33,7
4,1	10,6	29,5	0,83	36,3

Tables (Output of Computation)





Summary of computational transaction
Raw Inputview raw input (R code)
Raw Outputview raw output of R engine
Computing time2 seconds
R Server'Gwilym Jenkins' @ 72.249.127.135

\begin{tabular}{lllllllll}
\hline
Summary of computational transaction \tabularnewline
Raw Input & view raw input (R code)  \tabularnewline
Raw Output & view raw output of R engine  \tabularnewline
Computing time & 2 seconds \tabularnewline
R Server & 'Gwilym Jenkins' @ 72.249.127.135 \tabularnewline
\hline
\end{tabular}
%Source: https://freestatistics.org/blog/index.php?pk=21649&T=0

[TABLE]
[ROW][C]Summary of computational transaction[/C][/ROW]
[ROW][C]Raw Input[/C][C]view raw input (R code) [/C][/ROW]
[ROW][C]Raw Output[/C][C]view raw output of R engine [/C][/ROW]
[ROW][C]Computing time[/C][C]2 seconds[/C][/ROW]
[ROW][C]R Server[/C][C]'Gwilym Jenkins' @ 72.249.127.135[/C][/ROW]
[/TABLE]
Source: https://freestatistics.org/blog/index.php?pk=21649&T=0

Globally Unique Identifier (entire table): ba.freestatistics.org/blog/index.php?pk=21649&T=0

As an alternative you can also use a QR Code:  
QR Code


The GUIDs for individual cells are displayed in the table below:

Summary of computational transaction
Raw Inputview raw input (R code)
Raw Outputview raw output of R engine
Computing time2 seconds
R Server'Gwilym Jenkins' @ 72.249.127.135






Kendall tau rank correlations for all pairs of data series
pairtaup-value
tau( RNVM , RNR )0.7142857142857140.0301587301587301
tau( RNVM , RCF )0.5238095238095240.136111111111111
tau( RNVM , RLEZ )0.2646280620124820.427262856745706
tau( RNVM , REV )0.3333333333333330.381349206349206
tau( RNR , RCF )0.809523809523810.0107142857142857
tau( RNR , RLEZ )-0.05292561240249630.873844698517373
tau( RNR , REV )0.04761904761904761
tau( RCF , RLEZ )-0.2646280620124820.427262856745706
tau( RCF , REV )-0.1428571428571430.772619047619048
tau( RLEZ , REV )0.3704792868174740.266379923342483

\begin{tabular}{lllllllll}
\hline
Kendall tau rank correlations for all pairs of data series \tabularnewline
pair & tau & p-value \tabularnewline
tau( RNVM , RNR ) & 0.714285714285714 & 0.0301587301587301 \tabularnewline
tau( RNVM , RCF ) & 0.523809523809524 & 0.136111111111111 \tabularnewline
tau( RNVM , RLEZ ) & 0.264628062012482 & 0.427262856745706 \tabularnewline
tau( RNVM , REV ) & 0.333333333333333 & 0.381349206349206 \tabularnewline
tau( RNR , RCF ) & 0.80952380952381 & 0.0107142857142857 \tabularnewline
tau( RNR , RLEZ ) & -0.0529256124024963 & 0.873844698517373 \tabularnewline
tau( RNR , REV ) & 0.0476190476190476 & 1 \tabularnewline
tau( RCF , RLEZ ) & -0.264628062012482 & 0.427262856745706 \tabularnewline
tau( RCF , REV ) & -0.142857142857143 & 0.772619047619048 \tabularnewline
tau( RLEZ , REV ) & 0.370479286817474 & 0.266379923342483 \tabularnewline
\hline
\end{tabular}
%Source: https://freestatistics.org/blog/index.php?pk=21649&T=1

[TABLE]
[ROW][C]Kendall tau rank correlations for all pairs of data series[/C][/ROW]
[ROW][C]pair[/C][C]tau[/C][C]p-value[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RNVM , RNR )[/C][C]0.714285714285714[/C][C]0.0301587301587301[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RNVM , RCF )[/C][C]0.523809523809524[/C][C]0.136111111111111[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RNVM , RLEZ )[/C][C]0.264628062012482[/C][C]0.427262856745706[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RNVM , REV )[/C][C]0.333333333333333[/C][C]0.381349206349206[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RNR , RCF )[/C][C]0.80952380952381[/C][C]0.0107142857142857[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RNR , RLEZ )[/C][C]-0.0529256124024963[/C][C]0.873844698517373[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RNR , REV )[/C][C]0.0476190476190476[/C][C]1[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RCF , RLEZ )[/C][C]-0.264628062012482[/C][C]0.427262856745706[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RCF , REV )[/C][C]-0.142857142857143[/C][C]0.772619047619048[/C][/ROW]
[ROW][C]tau( RLEZ , REV )[/C][C]0.370479286817474[/C][C]0.266379923342483[/C][/ROW]
[/TABLE]
Source: https://freestatistics.org/blog/index.php?pk=21649&T=1

Globally Unique Identifier (entire table): ba.freestatistics.org/blog/index.php?pk=21649&T=1

As an alternative you can also use a QR Code:  
QR Code


The GUIDs for individual cells are displayed in the table below:

Kendall tau rank correlations for all pairs of data series
pairtaup-value
tau( RNVM , RNR )0.7142857142857140.0301587301587301
tau( RNVM , RCF )0.5238095238095240.136111111111111
tau( RNVM , RLEZ )0.2646280620124820.427262856745706
tau( RNVM , REV )0.3333333333333330.381349206349206
tau( RNR , RCF )0.809523809523810.0107142857142857
tau( RNR , RLEZ )-0.05292561240249630.873844698517373
tau( RNR , REV )0.04761904761904761
tau( RCF , RLEZ )-0.2646280620124820.427262856745706
tau( RCF , REV )-0.1428571428571430.772619047619048
tau( RLEZ , REV )0.3704792868174740.266379923342483


Figures (Output of Computation)

Input Parameters & R Code

Parameters (Session):
Parameters (R input):
R code (references can be found in the software module):
panel.tau <- function(x, y, digits=2, prefix='', cex.cor)
{
usr <- par('usr'); on.exit(par(usr))
par(usr = c(0, 1, 0, 1))
rr <- cor.test(x, y, method='kendall')
r <- round(rr$p.value,2)
txt <- format(c(r, 0.123456789), digits=digits)[1]
txt <- paste(prefix, txt, sep='')
if(missing(cex.cor)) cex <- 0.5/strwidth(txt)
text(0.5, 0.5, txt, cex = cex)
}
panel.hist <- function(x, ...)
{
usr <- par('usr'); on.exit(par(usr))
par(usr = c(usr[1:2], 0, 1.5) )
h <- hist(x, plot = FALSE)
breaks <- h$breaks; nB <- length(breaks)
y <- h$counts; y <- y/max(y)
rect(breaks[-nB], 0, breaks[-1], y, col='grey', ...)
}
bitmap(file='test1.png')
pairs(t(y),diag.panel=panel.hist, upper.panel=panel.smooth, lower.panel=panel.tau, main=main)
dev.off()
load(file='createtable')
a<-table.start()
a<-table.row.start(a)
a<-table.element(a,'Kendall tau rank correlations for all pairs of data series',3,TRUE)
a<-table.row.end(a)
a<-table.row.start(a)
a<-table.element(a,'pair',1,TRUE)
a<-table.element(a,'tau',1,TRUE)
a<-table.element(a,'p-value',1,TRUE)
a<-table.row.end(a)
n <- length(y[,1])
n
cor.test(y[1,],y[2,],method='kendall')
for (i in 1:(n-1))
{
for (j in (i+1):n)
{
a<-table.row.start(a)
dum <- paste('tau(',dimnames(t(x))[[2]][i])
dum <- paste(dum,',')
dum <- paste(dum,dimnames(t(x))[[2]][j])
dum <- paste(dum,')')
a<-table.element(a,dum,header=TRUE)
r <- cor.test(y[i,],y[j,],method='kendall')
a<-table.element(a,r$estimate)
a<-table.element(a,r$p.value)
a<-table.row.end(a)
}
}
a<-table.end(a)
table.save(a,file='mytable.tab')